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Cambios lingüísticos entre los preprints y las publicaciones

Nicholson DN, Rubinetti V, Hu D, Thielk M, Hunter LE, Greene CS (2022) Examining linguistic shifts between preprints and publications. PLoS Biol 20(2): e3001470. https://doi.org/10.1371/journal.pbio.3001470

Los preprints permiten a los investigadores poner sus hallazgos a disposición de la comunidad científica antes de que hayan sido sometidos a la revisión por pares. Los estudios sobre preprints en bioRxiv se han centrado en gran medida en los metadatos de los artículos y en la frecuencia con la que estos preprints se descargan, se citan, se publican y se discuten en línea. Un elemento que falta por examinar es el lenguaje contenido en el repositorio de preprints de bioRxiv. Por ello se Intento comparar y contrastar las características lingüísticas de los preprints de bioRxiv con el texto biomédico publicado en su conjunto, ya que es una excelente oportunidad para examinar cómo la revisión por pares cambia estos documentos.

Los rasgos más frecuentes que cambiaron parecen estar asociados a la composición tipográfica y a las menciones de secciones de información de apoyo o archivos adicionales. Además de la comparación de textos, se crearon inserciones de documentos derivadas de un modelo word2vec entrenado previamente. Se descubrió que estas inserciones son capaces de analizar diferentes enfoques y conceptos científicos, vincular pares de artículos revisados por pares sin anotar e identificar revistas que publican artículos lingüísticamente similares a un preprint determinado. También se utilizaro estas inserciones para examinar los factores asociados con el tiempo transcurrido entre la publicación de un primer preprint y la aparición de una publicación revisada por pares. Descubrimos que los preprints con más versiones publicadas y más cambios textuales tardaban más en publicarse.

Por último, se construyó una aplicación web que permite a los usuarios identificar qué revistas y artículos son más similares lingüísticamente a un preprint de bioRxiv o medRxiv, así como observar dónde se posicionaría el preprint dentro del panorama de artículos publicados.

CCSD y COAR anuncian planes para lanzar un directorio de preprints

El Centre pour la Communication Scientifique Directe (CCSD) de Francia y Confederation of Open Access Repositories (COAR) se complacen en anunciar su colaboración formal para lanzar un directorio de repositorios de preprints de acceso abierto.

Los preprints se están convirtiendo en una parte cada vez más importante del panorama de las comunicaciones de investigación. La publicación de preprints permite a los investigadores compartir su investigación de forma libre y rápida con sus colegas y la comunidad en general. Sin embargo, la comunidad no dispone de una herramienta única para ver el panorama actual de los preprints. Los registros existentes son exhaustivos y abarcan todos los tipos de repositorios o se centran en los preprints de una sola disciplina. Este directorio reunirá todos los repositorios que recogen preprints en una única base de datos, lo que permitirá a los usuarios elegir la plataforma más adecuada para sus necesidades y tener una visión general del ecosistema de preprints.

El directorio se basará en los resultados de un proyecto llevado a cabo por el French Committee for Open Science (Preprints Platforms Project) y apoyado por el French Ministry of Higher Education, Research and Innovation (MESRI), que ha desarrollado un amplio y detallado catálogo de repositorios de preprints. La lista actual de preprints documenta más de 90 repositorios de preprints junto con detalles sobre su gestión, funcionalidades y servicios relacionados y su relación con los criterios de la ciencia abierta.

Como parte de la colaboración, el COAR desarrollará una base de datos y una interfaz de usuario con la aportación del Proyecto de Plataformas de Preprints y el apoyo del MESRI. COAR albergará el directorio de preprints y el CCSD se encargará de conservar los registros de metadatos para garantizar que el registro se mantenga actualizado. El directorio estará disponible públicamente para todos y, en la medida de lo posible, se alineará con otros directorios relacionados, como OpenDOAR y la lista de servidores de preprints de ASAPbio.

Fuente: COAR

Plan S de Shock: la iniciativa de acceso abierto que cambió la cara de la investigación mundial

Robert-Jan Smits, Rachael Pells. Plan S for Shock: Science. Shock. Solution. Speed. Ubiquity Press, 2022

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Esta es la historia de la publicación en acceso abierto: por qué es importante ahora y para el futuro. En un mundo en el que la información nunca ha sido tan accesible y en el que las respuestas están disponibles al alcance de la mano, estamos más hambrientos de hechos que nunca, algo que la crisis de Covid-19 ha puesto de manifiesto. Y, sin embargo, las barreras de pago impuestas por editoriales multimillonarias siguen impidiendo a millones de personas acceder a conocimientos científicos de calidad, y la confianza del público en la ciencia está amenazada.

El 4 de septiembre de 2018, se dio a conocer una nueva y audaz iniciativa conocida como «Plan S», que dio el pistoletazo de salida a un cambio de actitud a nivel mundial hacia la investigación de acceso abierto. Por primera vez, las agencias de financiación de todos los continentes unieron sus fuerzas para imponer nuevas normas sobre la publicación de la investigación, con el objetivo de que algún día toda la investigación sea gratuita y esté disponible para todos.

Lo que siguió fue un debate de proporciones mundiales, ya que las partes interesadas se preguntaron: ¿Quién tiene derecho a acceder a la investigación financiada con fondos públicos? ¿Será posible imponer el cambio en un mercado multimillonario dominado por cinco grandes compañías?

Aquí, el fundador del sistema, Robert-Jan Smits, presenta un argumento convincente a favor del acceso abierto y revela por primera vez cómo se dispuso a hacer realidad su controvertido plan, así como algunos de los retos a los que se enfrentó en el camino. Al contar su historia, Smits sostiene que la crisis de Covid-19 ha puesto de manifiesto que el sistema tradicional de publicación académica es insostenible.


Cómo depositar nuestro artículo en acceso abierto en un repositorio institucional DSPACE

Cómo depositar nuestro artículo en acceso abierto en un repositorio institucional DSPACE

Open Access es el término utilizado para describir el libre acceso universal a los resultados de la investigación. ¿Si el 92% de los investigadores buscan información en GOOGLE como podemos hacer para que nuestros documentos estén indexados por este recurso? Una de las formas más efectivas para ello es depositar nuestra investigación en un repositorio de acceso abierto. Tal como comentamos en el capítulo dedicado al acceso abierto, hay muchos estudios, tanto mayores como menores, que informan que el acceso abierto da lugar significativamente a más citas. Pues al disponer libremente de los resultados de la investigación, más personas pueden acceder a ese contenido por encima de barreras económicas o de otro tipo. Pero además porque estos documentos son indexados por Google, ya que dispone de un metadato que asegura que este motor de búsqueda indexe el documento de cara a su descubrimiento, y que sean recopilados por los recolectores de metadatos OAI-PMH, lo que acrecienta considerablemente la visibilidad de esa información.

ROAM, Repositorio de Recursos Educativos Abiertos de la Universidad de Penn State

https://roam.libraries.psu.edu/

ROAM ofrece materiales de aprendizaje de alta calidad escritos por profesores de Penn State. Estos materiales están disponibles de forma gratuita para su uso, reutilización, revisión, remezcla y redistribución bajo una licencia Creative Commons.

La unidad Open Publishing de las Bibliotecas de la Universidad de Penn State ha lanzado recientemente ROAM, un servicio de publicación en línea recientemente ampliado para materiales educativos con licencia abierta de los que es autor el profesorado de Penn State. La plataforma «Repository of Open and Affordable Materials» (Repositorio de materiales abiertos y asequibles), se basa en un servicio creado y alojado anteriormente por la Facultad de Ciencias de la Tierra y los Minerales (EMS), que publica la mayor parte del material didáctico de la facultad de forma gratuita para que cualquiera pueda acceder a él. ROAM ampliará la visión de EMS para incluir contenidos de todas las disciplinas y campus de la Universidad.

«ROAM se basa en el sólido compromiso de las bibliotecas universitarias con el acceso equitativo a la información, el éxito de los estudiantes y la apertura», dijo Rebecca Miller Waltz, decana interina de los servicios de aprendizaje y de pregrado de las bibliotecas universitarias. «Al igual que ScholarSphere hace que las publicaciones, los datos y las presentaciones de Penn State estén disponibles de forma abierta, ROAM pondrá a disposición de nuestra comunidad y del mundo los recursos educativos abiertos y asequibles de alta calidad creados en Penn State».

Bryan McGeary, bibliotecario de diseño de aprendizaje y compromiso con la educación abierta de Penn State, coordina y contribuye a numerosos esfuerzos diseñados para promover e integrar la educación abierta en la experiencia de los estudiantes en toda la Universidad. McGeary considera el repositorio como un medio por el cual Penn State puede participar en un movimiento global más amplio en la educación.

«Los recursos educativos abiertos (REA), como los alojados en ROAM, benefician a los estudiantes y al profesorado al proporcionarles acceso gratuito a los materiales del curso y nuevas oportunidades de innovación pedagógica», dijo. «Con el acceso mundial que ROAM proporciona a los REA de Penn State, la Universidad está preparada para ser un líder internacional en educación abierta y asequible».

Análisis de los preprints en los repositorios institucionales y generalistas

Kathleen Shearer, Jessica Polka. Delving deeper into preprints in institutional and generalist repositories. COAR, 2022

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A finales del verano de 2021, el COAR y ASAPbio llevaron a cabo una encuesta entre los repositorios institucionales y generalistas (IR) para conocer sus prácticas y planes en relación con la recogida de preprints. Los resultados preliminares revelaron que aproximadamente dos tercios de los repositorios que respondieron albergan actualmente preprints.

116 repositorios institucionales y generalistas de 35 países respondieron a la encuesta, incluyendo una representación particularmente fuerte de Brasil, el Reino Unido (UK) y los Estados Unidos (US). Con más de 3.000 repositorios institucionales y generalistas de todo el mundo, los encuestados representan una muestra muy pequeña y, por tanto, los resultados no deben generalizarse. De las 116 respuestas que se analizaron, el 61% (71) de los encuestados declararon albergar actualmente preprints.

Varios repositorios (12) indicaron que no saben cuántos preprints tienen en sus colecciones. Esto se debe probablemente a que no distinguen entre preprints y otras versiones de artículos en sus registros de metadatos.

En el caso de los repositorios que sí etiquetan los preprints de forma única (53), el número medio de preprints en sus colecciones era de 704. En particular, este número es significativamente mayor que las colecciones de algunos servidores de preprints existentes. La mayoría de los encuestados que alojan preprints (68%) tampoco estaban seguros de si una parte de los preprints de sus colecciones estaban también alojados en un servidor de preprints.

Se preguntó a los encuestados si sus repositorios admiten algunas de las funcionalidades comunes que ofrecen los servicios de preprints dedicados. Entre los 71 repositorios que alojan preprints, la mayoría (62%) enlaza con la versión publicada. La asignación del DOI (40%) y el soporte para el versionado (32%) son también características comunes. Por otro lado, el cribado (16%), el enlace a revisiones externas por pares (10%), las herramientas de comentarios (7%) y los banners o avisos de responsabilidad que explican lo que es un preprint (5%) se admiten con menos frecuencia.

La comunidad de preprints ha estado desarrollando buenas prácticas que responden a los desafíos únicos asociados con la gestión de preprints, tales como la identificación de las versiones de preprints, la vinculación con las versiones de revistas, y el etiquetado transparente de estos objetos para aclarar su estado de revisión por pares a una amplia gama de lectores. En el ámbito biomédico, los criterios de indexación de preprints de Europe PMC y NCBI definen características importantes que afectan a la visibilidad de los preprints en estas bases de datos, y como tales pueden influir en las decisiones de los servidores de preprints en estas disciplinas. Todavía no está claro cómo se puede dar soporte a los requisitos únicos de gestión de preprints en repositorios con un mandato más amplio y con acceso a diversos tipos de recursos. Sin embargo, a medida que se generaliza la compartición de preprints, está claro que estos repositorios generalistas tienen un papel que desempeñar en el apoyo a la compartición abierta y temprana de los manuscritos de investigación, especialmente en los casos en que los investigadores prefieren publicar sus preprints en una infraestructura local o nacional o en los que las instituciones buscan archivar una colección más completa de productos académicos.

Para ayudar a la comunidad a apoyar mejor la compartición de preprints, COAR y ASAPbio convocarán conjuntamente un grupo de trabajo para entender mejor los retos de los repositorios, desarrollar recomendaciones de buenas prácticas y definir una estrategia para avanzar en la recogida de preprints en repositorios institucionales y generalistas.

El acceso abierto a las publicaciones de investigación en las universidades europeas

“A Closer Look at Open Access to Research Publications in European Universities”. European University Association, 2022

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Este informe presenta específicamente las conclusiones sobre el acceso abierto de la Open Science Survey 2020-2021 de la EUA.

¿Cómo supervisan las universidades las actividades de acceso abierto? ¿Cómo se están preparando las universidades para la aplicación del Plan S, que se aplicará a todos los beneficiarios de la financiación de Horizon Europe? ¿Qué medidas importantes han tomado recientemente las universidades para impulsar la aplicación del acceso abierto?

Este seguimiento de la Encuesta 2020-21 EUA Open Science Survey 2020-21 aborda estas y otras preguntas, proporcionando una mayor comprensión de las experiencias de las universidades en materia de acceso abierto.

Forma parte de una serie de tres informes de seguimiento del informe principal de la Open Science Survey de la EUA 2020-2021, que examinan en mayor profundidad la Ciencia Abierta en la evaluación académica y los datos de investigación. El tercer informe (que se publicará en 2022) examinará más detenidamente el tema de los datos de investigación

Instituciones de conocimiento abierto: reinventar las universidades

Montgomery, Lucy, et al. Open Knowledge Institutions: Reinventing Universities. MIT Press, 2021.

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El futuro de la universidad como institución de conocimiento abierto que institucionaliza la diversidad y contribuye a un recurso común de conocimiento: un manifiesto.

En este libro, un grupo diverso de autores -entre los que se encuentran pioneros del acceso abierto, comunicadores científicos, académicos, investigadores y administradores universitarios- ofrecen una propuesta audaz: las universidades deben convertirse en instituciones de conocimiento abierto, actuando con los principios de apertura en su centro y trabajando a través de las fronteras y con amplias comunidades para generar recursos de conocimiento compartido en beneficio de la humanidad. Los autores, que piden a las universidades que adopten protocolos transparentes para la creación, el uso y la gestión de estos recursos, se basan en trabajos teóricos de vanguardia, ofrecen estudios de casos reales y esbozan formas de evaluar los intentos de las universidades por lograr la apertura.

Mantener los contenidos y la infraestructura abiertos

Mary Lee Kennedy and Judy Ruttenberg. Sustaining Open Content and Infrastructure. Research Library Issues 302, The Association of Research Libraries (ARL)  2021

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Guía para la evaluación de repositorios institucionales de investigación. 4ª ed. mayo 2021

Guía para la evaluación de repositorios institucionales de investigación. 4ª ed. mayo 2021

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Esta Guía ofrece a toda la comunidad nacional un conjunto de directrices, basadas en criterios internacionales ya existentes, que garantizan la interoperabilidad de todos los recursos de acceso abierto y aseguran un acceso de calidad a sus contenidos. Disponer de esta herramienta de autoevaluación supone una importante ayuda a la hora de detectar puntos fuertes y áreas de mejora, lo cual contribuye a incrementar el alcance y la visibilidad de los repositorios entre la comunidad científica. Además, para los repositorios que se encuentran en fase de planificación, este documento ofrece las pautas necesarias a tener en cuenta para crear una infraestructura robusta y visible.